എന്താണ് ഒരു പി.ഡി.ബി ഫയൽ?

എങ്ങനെയാണ് പി.ഡി.ബി ഫയലുകൾ തുറക്കാനും എഡിറ്റുചെയ്യാനും പരിവർത്തനം ചെയ്യാനും

PDB ഫയൽ എക്സ്റ്റൻഷനുള്ള ഒരു ഫയൽ ഒരു പ്രോഗ്രാം അല്ലെങ്കിൽ മൊഡ്യൂളിനെക്കുറിച്ചുള്ള ഡീബഗ്ഗ് ചെയ്യുന്ന വിവരങ്ങൾ ഡിഎൽഎൽ അല്ലെങ്കിൽ EXE ഫയൽ പോലെയുള്ള പ്രോഗ്രാമിലെ ഡാറ്റാബേസ് ഫോർമാറ്റിലാണ് സൃഷ്ടിച്ചിരിക്കുന്നത്. അവ ചിലപ്പോൾ ചിഹ്ന ഫയലുകളെ വിളിക്കുന്നു.

PDB ഫയലുകൾ അതിന്റെ ഉറവിട കോഡിലെ വ്യത്യസ്ത ഘടകങ്ങളും പ്രസ്താവനകളും മാപ്പുചെയ്യുന്നു, ഡീബഗ്ഗിംഗ് ഉപയോഗിച്ച് തുടർന്ന് ഡീബഗ്ഗിംഗ് പ്രോസസ് നിർത്തേണ്ട ഉറവിട ഫയലും ലൊക്കേഷനും കണ്ടെത്താൻ ഡീബഗ്ഗർ ഉപയോഗിക്കാം.

ചില PDB ഫയലുകൾ പകരം പ്രോട്ടോൺ ഡാറ്റാ ബാങ്ക് ഫയൽ ഫോർമാറ്റിൽ ആയിരിക്കും. പ്രോട്ടീൻ ഘടനകളെ സംബന്ധിച്ച കോർഡിനേറ്റുകൾ സൂക്ഷിക്കുന്ന പ്ലെയിൻ ടെക്സ്റ്റ് ഫയലുകളാണ് ഇവ.

മറ്റ് PDB ഫയലുകൾ ഒരു പാമ് ഡാറ്റാബേസ് അല്ലെങ്കിൽ പൽഡൊഡോക് ഫയൽ ഫോർമാറ്റിൽ സൃഷ്ടിക്കാം കൂടാതെ പൾമോസ് മൊബൈൽ ഓപ്പറേറ്റിങ് സിസ്റ്റവുമായി ബന്ധപ്പെട്ടും ഉപയോഗിക്കാം . ഈ ഫോർമാറ്റിലുള്ള ചില ഫയലുകൾ പകരം .PRC ഫയൽ എക്സ്റ്റൻഷൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു.

എങ്ങനെയാണ് PDB ഫയൽ തുറക്കുക?

വ്യത്യസ്ത പ്രോഗ്രാമുകൾ ഏതെങ്കിലും തരത്തിലുള്ള ഘടനാപരമായ ഡാറ്റാബേസ് ഫോർമാറ്റിൽ ഡാറ്റ സംഭരിക്കുന്നതിന് അവരുടെ സ്വന്തം PDB ഫയൽ ഉപയോഗപ്പെടുത്തുന്നു, അതിനാൽ ഓരോ ആപ്ലിക്കേഷനും അതിന്റെ സ്വന്തം പിഡിബി ഫയൽ തുറക്കാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു. ജീനിയസ്, Intuit Quicken, മൈക്രോസോഫ്റ്റ് വിഷ്വൽ സ്റ്റുഡിയോ, പെഗാസസ് എന്നിവ ഒരു PDB ഫയൽ ഡേറ്റാബേസ് ഫയൽ ആയി ഉപയോഗിക്കാവുന്ന പ്രോഗ്രാമുകളുടെ ചില ഉദാഹരണങ്ങളാണ്. പിഡിബി ഫയലുകൾ തുറക്കുന്നതിനു വേണ്ടി പ്രവർത്തിക്കും.

ചില PDB ഫയലുകൾ ജീനിഷ്യസ് 'പ്രോഗ്രാം ഡീബഗ് ഡാറ്റാബേസ് ഫയലുകൾ പോലെയുള്ള പ്ലെയിൻ ടെക്സ്റ്റായി സൂക്ഷിക്കുന്നു, കൂടാതെ ഒരു ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്ററിൽ തുറന്നാൽ പൂർണമായും മനുഷ്യർക്ക് വായിക്കാനാകും. വിൻഡോസിൽ ബിൽറ്റ്-ഇൻ നോട്ട്പാഡ് പ്രോഗ്രാം പോലെയുള്ള ടെക്സ്റ്റ് പ്രമാണങ്ങൾ വായിക്കാൻ കഴിയുന്ന ഏതെങ്കിലും പ്രോഗ്രാമിനോടൊപ്പം നിങ്ങൾക്ക് PDB ഫയൽ ഇത്തരത്തിലുള്ള തുറക്കാൻ കഴിയും. നോട്ട്പാഡ് ++, ബ്രാക്കറ്റ്സ് തുടങ്ങിയ മറ്റു ചില PDB ഫയൽ വ്യൂവറുകളും എഡിറ്റർമാരുമുണ്ട്.

മറ്റ് പിഡിബി ഡാറ്റാബേസ് ഫയലുകൾ ടെക്സ്റ്റ് ഡോക്യുമെന്റുകൾ അല്ലാത്തവയാണ്, അത് ഉദ്ദേശിച്ച പ്രോഗ്രാമിനായി തുറന്ന് പ്രവർത്തിക്കുമ്പോൾ മാത്രം ഉപയോഗപ്രദമാകും. ഉദാഹരണത്തിന്, നിങ്ങളുടെ PDB ഫയൽ ദ്രുതഗതിയിൽ ഏതെങ്കിലും വിധത്തിൽ ബന്ധപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, ആ സോഫ്റ്റ്വെയർ ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് പിഡിബി ഫയൽ കാണാനോ എഡിറ്റുചെയ്യാനോ ശ്രമിക്കുക. വിഷ്വൽ സ്റ്റുഡിയോ ഡിഎൽഎൽ അല്ലെങ്കിൽ എക്ഇഎ ഫയലിൻറെ അതേ ഫോൾഡറിൽ PDB ഫയൽ കാണാൻ പ്രതീക്ഷിക്കുന്നു.

പ്രോട്ടോൺ ഡേറ്റാ ബാങ്ക് ഫയലുകൾ, വിൻഡോസ്, ലിനക്സ്, മാകോസ് എന്നിവ അവഗാഡ്രോ ഉപയോഗിച്ചുള്ള PDB ഫയലുകളെ നിങ്ങൾക്ക് കാണാനും എഡിറ്റ് ചെയ്യാനും കഴിയും. Jmol, RasMol, QuickPDB, and USCF Chimera ഒരു PDB ഫയൽ തുറക്കാൻ കഴിയും. ഈ ഫയലുകൾ പ്ലെയിൻ ടെക്സ്റ്റ് ആയതിനാൽ, നിങ്ങൾക്ക് PDB ഫയൽ ഒരു ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്ററിൽ തുറക്കാൻ കഴിയും.

പാം ഡസ്ക്ടോപ്പ് ഫയൽ ഫോർമാറ്റിലുള്ള പിഡിബി ഫയലുകൾ ഓപ്പൺ ചെയ്യാൻ പാംപണിക്ക് സാധിക്കും. പക്ഷേ, ആദ്യം പ്രോഗ്രാമിനായി പിആർസി ഫയൽ എക്സ്റ്റൻഷൻ ഉണ്ടായിരിക്കണം. ഒരു PalmDOC PDB ഫയൽ തുറക്കാൻ, STDU വ്യൂവർ പരീക്ഷിക്കുക.

ഒരു PDB ഫയൽ എങ്ങനെയാണ് പരിവർത്തനം ചെയ്യുക

പ്രോഗ്രാമിന്റെ ഡാറ്റാബേസ് ഫയലുകൾ മിക്കവാറും മറ്റൊരു ഫയൽ ഫോർമാറ്റായി പരിവർത്തനം ചെയ്യപ്പെടുന്നില്ല, കുറഞ്ഞത് ഒരു സാധാരണ ഫയൽ കൺവേർട്ടർ ടൂളിലല്ല . പകരം, ഇത്തരത്തിലുള്ള പിഡിബി ഫയൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ കഴിയുന്ന ഒരു ഉപകരണം ഉണ്ടെങ്കിൽ, അത് തുറക്കാൻ കഴിയുന്ന അതേ പ്രോഗ്രാമും അതായിരിക്കും.

ഉദാഹരണത്തിനു്, നിങ്ങളുടെ പിഡിബി ഡാറ്റാബേസ് ഫയൽ ദ്രുതഗതിയിൽ നിന്നും പരിവർത്തനം ചെയ്യണമെങ്കിൽ ആ പ്രോഗ്രാം ഉപയോഗിച്ചു് അത് ചെയ്യാൻ ശ്രമിക്കുക. ഈ തരത്തിലുള്ള പരിവർത്തനം ഒരുപക്ഷേ, വളരെ ചെറിയ ഉപയോഗം മാത്രമായിരിക്കില്ല, മാത്രമല്ല ഈ ഡാറ്റാബേസ് ആപ്ലിക്കേഷനുകളിൽ പിന്തുണയ്ക്കില്ല (അതായത്, ഇത്തരത്തിലുള്ള PDB ഫയൽ മറ്റേതെങ്കിലും ഫോർമാറ്റിലേക്ക് മാറ്റേണ്ടി വരില്ല).

പ്രോട്ടീൻ ഡാറ്റാ ബാങ്ക് ഫയലുകൾ മെഷാബബ് ഉപയോഗിച്ച് മറ്റ് ഫോർമാറ്റുകളെ പരിവർത്തനം ചെയ്യാനാകും. ഇതിനായി, ഫയൽ> സേവ് ഇമേജ് ആസ്ക്> VRML മെനുവിൽ നിന്ന് പിഎംഒഎൽ ഉപയോഗിച്ച് പി.ഡി.ബോൾ ഫയൽ ഫോർമാറ്റ് ചെയ്യേണ്ടിവരും. തുടർന്ന്, മെഷാബിൽ വലത് ഫയൽ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, തുടർന്ന് ഫയൽ> എക്സ്പോർട്ട് മെഷ് മെനു ഉപയോഗിക്കുക. STL അല്ലെങ്കിൽ മറ്റൊരു ഫയൽ ഫോർമാറ്റിലേക്ക് ഫയൽ ചെയ്യുക.

നിങ്ങൾക്ക് മോഡൽ ആവശ്യമില്ലെങ്കിൽ, നിങ്ങൾക്ക് PDB ഫയൽ നേരിട്ട് STC ലേക്ക് യുഎസ്സിഎഫ് ചീമരാജ (ഡൌൺലോഡ് ലിങ്ക് മുകളിലാണ്) ഉപയോഗിച്ച് എക്സ്പോർട്ട് ചെയ്യാം. അല്ലാത്തപക്ഷം, അതേ രീതിയിൽ തന്നെ (മെഷ്ലേബ്), യുഎസ്സിഎഫ് ചീമറയുമായി വിർച്വൽ കൺസൾട്ടൻസിയിലേക്ക് മാറ്റുകയും, പിന്നീട് മെഷാബ് ഉപയോഗിച്ച് എസ്.ആർ.എൽ.

പിഡിബിക്ക് PDF അല്ലെങ്കിൽ EPUB ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ, നിങ്ങൾക്ക് ഒരു PalmDOC ഫയൽ ഉണ്ടെങ്കിൽ, ധാരാളം വഴികൾ സാധ്യമാണ്, എന്നാൽ സാമ്ജറിനെ പോലെയുള്ള ഒരു ഓൺലൈൻ PDB കൺവെർട്ടറെ ഉപയോഗിക്കുന്നതാണ് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ളത്. ആ ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകളിലേക്കും അതുപോലെ AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT, മറ്റ് ഇബുക്ക് ഫയൽ ഫോർമാറ്റിലേക്കും പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഓപ്ഷൻ നിങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റിൽ നിങ്ങളുടെ PDB ഫയൽ അപ്ലോഡ് ചെയ്യാൻ കഴിയും.

PDA ഫയൽ FASTA ഫോർമാറ്റിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ, മീസർ ലാബിലെ ഓൺലൈൻ PDB ഉപയോഗിച്ച് FASTA കൺവെർട്ടർ ഉപയോഗിച്ച് ചെയ്യാം.

PDBx / mmCIF ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനിൽ സിബിഐ (ക്രിസ്റ്റലോഗ്രഫിക് ഇൻഫർമേഷൻ ഫോർമാറ്റ്) PDB ക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യാനും സാധിക്കും.

പിഡിബി ഫയലുകളിൽ വിപുലമായ വായന

Microsoft, GitHub, Wintellect എന്നിവയിൽ നിന്നുള്ള പ്രോഗ്രാം ഡാറ്റാബേസ് ഫയലുകൾ നിങ്ങൾക്ക് കൂടുതൽ വായിക്കാം.

പ്രോട്ടോൺ ഡേറ്റാ ബാങ്ക് ഫയലുകളെ കുറിച്ചും കൂടുതലറിയാൻ. ലോകവ്യാപക പ്രോട്ടീൻ ഡാറ്റാ ബാങ്കും ആർസിഎസ്ബി PDB ഉം കാണുക.

നിങ്ങളുടെ ഫയൽ ഇപ്പോഴും ആരംഭിച്ചിട്ടില്ലേ?

PDB ഫയലുകൾ മുകളിൽ നിന്നും ഏതെങ്കിലും ഉപകരണങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് തുറക്കുന്നില്ല, ഒരുപക്ഷേ യഥാർത്ഥത്തിൽ PDB ഫയലുകൾ അല്ല. എന്താണ് സംഭവിക്കുന്നത് നിങ്ങൾ ഫയൽ വിപുലീകരണം തെറ്റായാണ് ചെയ്യുന്നത്; ചില ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ ഒരു സഫിക്സ് ഉപയോഗിക്കുന്നു. "പി.ഡി.ബി" അവർ യഥാർത്ഥത്തിൽ ബന്ധമില്ലാത്തതും അതേ സമയം പ്രവർത്തിക്കുന്നില്ല.

ഉദാഹരണത്തിന്, ഒരു PDF ഫയൽ ഒരു പ്രമാണ ഫയലാണ്, എന്നാൽ ഈ സോഫ്റ്റ്വെയറുകളുമായി നിങ്ങൾ തുറക്കാൻ ശ്രമിച്ചാൽ മുകളിൽ പറഞ്ഞ പ്രോഗ്രാമുകൾ ടെക്സ്റ്റ് കൂടാതെ / അല്ലെങ്കിൽ ചിത്രങ്ങൾ ശരിയായി നൽകില്ല. അതേപോലെ, പിഡി, പിഡിഇ, പിഡിസി, പിഡിഒ ഫയലുകൾ പോലുള്ള വിപുലീകരിക്കപ്പെട്ട ഫയൽ എക്സ്റ്റെൻഷനുകളുള്ള മറ്റ് ഫയലുകൾക്കും ഇത് ശരിയാണ്.

പിസിഡി ആണ് ഈസിഡൊ ടോഡൊ ബാക്കപ്പ് പ്രോഗ്രാമിന്റെ ഭാഗമായ മറ്റൊന്ന്, ആ സോഫ്റ്റ്വെയറിനൊപ്പം തുറക്കുമ്പോൾ ഉപയോഗപ്രദമാകുന്നത്.

നിങ്ങൾക്ക് ഒരു PDB ഫയൽ ഇല്ലെങ്കിൽ, ഫയൽ തുറക്കാനുള്ള ഫയൽ എക്സ്റ്റെൻഷൻ അന്വേഷിക്കുക, അങ്ങനെ തുറക്കുന്ന അല്ലെങ്കിൽ മാറ്റുന്ന ഉചിതമായ പ്രോഗ്രാം നിങ്ങൾക്ക് കണ്ടെത്താനാകും.